Das Apian-Gymnasium hält in der Begabungsförderung folgende Angebote bereit:
- als
Stützpunktschule
leistungssportlichen Unterricht in den Sportarten Fußball, Schwimmen und Tennis - Einführung einer Sportklasse in der 5. Jgst. im Schuljahr 2016/2017
- Erfinderclub
Querdenker
Die Schule ist zudem eine von bayernweit neun Modellschulen des Pilotprojekts »Partnerschulen des Sommersports«, die mit olympischen Sportfachverbänden kooperieren, um sportlich besonders begabte Schülerinnen und Schüler der 5. bis 8. Jahrgangsstufe sowohl in der Schule als auch im Sport gezielt zu fördern und bestmöglich zu unterstützen. Das Gymnasium arbeitet mit dem Trainingszentrum Oberbayern in den Sportarten Schwimmen und Triathlon zusammen.
Das Apian-Gymnasium ist Referenzgymnasium der Technischen Universität München (TUM).